中间偃麦草Na+/H+逆向转运蛋白的分子克隆及生物信息学分析

• 作者: 关宁 张耿 李源 王学敏 王赞 高洪文
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 生物学
• 关键词: 中间偃麦草 Na+/H+逆向转运蛋白 生物信息学
• 年，卷（期）: 2007,（10）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1263-1270
• 页数: 8页
• 分类号: Q94
• 字数: 4800字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0253-9772.2007.10.016

摘要

根据小麦液泡膜Na+/H+逆转运蛋白基因TaNHX1的全长序列设计引物,通过RT-PCR直接扩增的方法从中间偃麦草(Elytrigia intermedia)中克隆到了TaNHX1的同源基因,命名为TiNHX1(Acession Numeber:EF409418).TiNHX1最大开放阅读框为1 641 bp,编码含有546个氨基酸残基、分子量为59.8 kDa的蛋白,预测等电点8.0.TiNHX1含有38个碱性氨基酸,36个酸性氨基酸,256个疏水氨基酸及129个极性氨基酸.二级结构预测表明该蛋白含约44%的a-螺旋、21%的p-折叠、4%的p-转角和29%的不规则卷曲.亲疏水性分析显示,TiNHX1含有12个连续的疏水片断,其中10个可能构成穿膜螺旋.序列分析显示,TiNHX1与小麦(Triticum aestivum)、长穗偃麦草(Elytrigia elongate)、水稻(Oryza sativa)、小盐芥(Thellungiella halophila)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)等植物的液泡膜Na+/H+逆向转运蛋白高度同源,序列相似性分别为97%、96%、85%、68%、67%.序列比对结果以及进化树分析均表明TiNHX1应为定位于中间偃麦草液胞膜上的Na+/H+逆向转运蛋白.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王赞	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	62	994	17.0	28.0
2	高洪文	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	107	2252	23.0	42.0
3	李源	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	14	328	9.0	14.0
4	张耿	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	9	205	7.0	9.0
5	王学敏	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	25	179	9.0	12.0
6	关宁	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	9	173	6.0	9.0