亚洲牛带绦虫Spef1-Like基因及其蛋白结构特征的生物信息学分析

• 作者: 余新炳 包怀恩 徐劲 胡旭初 郎书源 黄江 黄灿
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 亚洲牛带绦虫 SPEF1-LIKE-Like蛋白 生物信息学 结构和功能
• 年，卷（期）: 2007,（12）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 1212-1215
• 页数: 4页
• 分类号: R383.3
• 字数: 3599字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2007.12.012

摘要

目的 分析和预测亚洲牛带绦虫的Spefl-Like基因及其编码的蛋白质的结构和功能.方法 利用生物信息学网站如美国国家生物技术中心(NCBI,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)和瑞士生物信息学研究所的蛋白分析专家系统(ExPASY,http://ca.expasy.org/)所提供的有关基因和蛋白序列和结构功能分析工具,以及专业的生物信息学软件包如pcgene,Vector NTI suite,从亚洲牛带绦虫成虫cDNA文库当中识别该基因及编码区,分析和预测该基因编码的蛋白质的理化性质,一级结构中的修饰位点及模序,亚细胞定位特征,二级结构特征以及蛋白三维空间构象,蛋白亲水性及潜在抗原表位.结果 该基因全长1099bp.编码区为117-929bp,编码271个氨基酸,与GenBank当中的其他序列比对.预测该基因为全长基因.编码的蛋白质理化性质比较稳定,含有多个能被其他酶修饰的位点,无跨膜区,预测其主要含有三个亲水性较强的抗原表位,空间结构上相距较近.结论 生物信息方法可从亚洲牛带绦虫成虫cDNA文库中筛选出Spef1-like基因并进行分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郎书源	贵阳医学院寄生虫学教研室	47	431	11.0	19.0
2	包怀恩	贵阳医学院寄生虫学教研室	110	773	14.0	22.0
3	余新炳	中山大学中山医学院寄生虫学教研室	201	1352	17.0	28.0
4	徐劲	中山大学中山医学院寄生虫学教研室	104	568	13.0	17.0
5	胡旭初	中山大学中山医学院寄生虫学教研室	108	574	13.0	17.0
6	黄江	贵阳医学院寄生虫学教研室	76	329	11.0	14.0
7	黄灿	中山大学中山医学院寄生虫学教研室	22	139	6.0	11.0