致肾盂肾炎大肠杆菌132特异性基因的筛选

• 作者: 刘欣 张玉梅 陈锦英 高英堂
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 致肾盂肾炎大肠杆菌 抑制性消减杂交技术(SSH) 特异基因 斑点印迹
• 年，卷（期）: 2007,（5）
• 所属期刊栏目: 细菌学
• 页码范围: 428-431
• 页数: 4页
• 分类号: R6
• 字数: 3199字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j:issn:0254-5101.2007.05.010

摘要

目的 通过抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术,比较致肾盂肾炎大肠杆菌132(UPEC132)与非致病性E.coli K-12 MG1655之间基因组的差异,筛选UPEC132特有的基因片段.方法 应用SSH技术构建UPEC132(tester)与非致病性E.coli K-12 MG1655(driver)菌株差异DNA消减文库,经PCR和斑点印迹法筛选鉴定阳性克隆,并进行测序及生物信息学分析.结果 获得约1600个重组菌的UPEC132消减文库,随机挑取其中的300个克隆,有37个含有UPEC132特异的DNA序列.特异性片段测序后进行生物信息学分析,发现与其相关的37个基因为UPEC132所特有,其中1个为新发现的DNA片段,9个为与致病相关基因,7个为与代谢和物质转运相关基因,2个为与外膜蛋白相关基因,3个为与调节相关基因,10个为未知功能蛋白的基因,其他5个为功能未分类的基因.结论 SSH技术是筛选病原菌特异基因的有效方法,已确定了37个UPEC132的特异基因,为进一步阐明其致病分子机制打下了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高英堂		56	319	8.0	15.0
2	陈锦英	天津医科大学基础医学院	82	429	11.0	15.0
3	刘欣	天津医科大学基础医学院	46	305	10.0	15.0
4	张玉梅	天津医科大学基础医学院	2	14	2.0	2.0