分子模拟在生物化学中的应用实例

• 作者: 栗琳 王春芳 王靖方 魏冬青
• 来源期刊: 原子与分子物理学报
• 学科: 物理学
• 关键词: 分子模拟 1,3偶极环加成反应 H5N1高致病性禽流感病毒
• 年，卷（期）: 2007,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 316-320
• 页数: 5页
• 分类号: O561.1
• 字数: 1642字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-0364.2007.02.024

摘要

分子模拟是一种描述和模拟分子和分子体系运动状态和性质的方法.随着电子计算机技术的飞速发展,分子模拟进入了一个前所未有的新时代.在此之前,人们只能通过机械模型和纸笔计算进行简单的分子模拟,现在通过利用电子计算机人们可以做更为复杂、更为全面的分子模拟.本文通过两个实例来简单阐述了分子模拟在生物化学中的应用.一则是通过模拟膦酰基氧化腈和丙乙腈的1,3偶极环加成反应过程,用密度泛函理论方法在B3LYP/6-31G(d,p)水平上解释了得到2:1的加成产物的现象,来解释1,3偶极环加成反应得到2:1加成产物的现象.一则是通过结构生物信息学的方法建立H5N1高致病性禽流感病毒蛋白的三维结构,模拟其与一些药物分子的相互作用,研究H5N1的活性中心.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	魏冬青	上海交通大学生命科学与技术学院	22	74	5.0	7.0
2	栗琳	上海交通大学生命科学与技术学院	7	80	5.0	7.0
4	王靖方	上海交通大学生命科学与技术学院	4	30	2.0	4.0
6	王春芳	上海交通大学生命科学与技术学院	2	22	2.0	2.0