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采用蛋白指纹图谱技术筛选大肠癌肝转移特异性相关蛋白
采用蛋白指纹图谱技术筛选大肠癌肝转移特异性相关蛋白
作者:
吴保平
姜泊
崔丹瑜
李霆
王继德
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
大肠癌
肝转移
生物标志物
蛋白指纹图谱
表面增强激光解析电离飞行时间质谱
摘要:
目的:应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术从大肠癌及大肠癌肝转移患者中筛选出大肠癌肝转移患者血清特异性相关蛋白.方法:实验于2005-07/2006-09分别在南方医院消化中心实验室与解放军第一五○医院实验室完成.应用美国CipherGan公司IMAC3(lmmobitized Metal Affinity Capture,金属亲和表面)芯片和蛋白芯片仪检测44例大肠癌患者及36例大肠癌肝转移患者血清中的蛋白质相对含量.设定所有血清样本检测的蛋白质相对分子质量区间在1 500~20 000.利用PBSⅡ型蛋白质芯片阅读仪对IMAC 3芯片进行检测,所得到的蛋白质以波谱的形式表示.采用Biomarker Wizard软件对2组血清在相同质荷比的蛋白质含量数据进行方差分析,将分析所得到的含量有显著性差异(P<0.05)的蛋白质建立数据库,导入Biomarker Pattern智能统计分析软件,选择相应条件,对其进行分组统计,从而得到能够正确分组的特异性蛋白标志物并构建大肠癌肝转移的诊断模型.采用酶联免疫法检测相同血清标本中的CEA水平,与构建的诊断模型在大肠癌肝转移诊断中作比较.结果:①44例大肠癌患者与36例大肠癌肝转移患者的血清蛋白质在质荷比为2 685.64~11 813间有16个蛋白质含量有显著差异.②大肠癌组在质荷比为5 909处的蛋白质的相对含量高于大肠癌肝转移组[(30.1±9.6)%,(14.5±10.4)%,P≤0.01].③其中44例大肠癌患者中有38例患者被正确分组,36例大肠癌肝转移患者被正确识别,准确率为92.5%(74/80),灵敏度和特异性分别为100%(36/36),86.4%(38/44).结论:表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术快速、准确、灵敏度、特异性高,通过蛋白芯片仪发现的特异性相关蛋白,有望成为大肠癌肝转移诊断中有应用价值的临床检测指标.
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应用生物信息学筛选大肠癌转移相关小分子化合物
差异表达
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转移
tanespimycin
生物信息学
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文献信息
篇名
采用蛋白指纹图谱技术筛选大肠癌肝转移特异性相关蛋白
来源期刊
中国组织工程研究与临床康复
学科
医学
关键词
大肠癌
肝转移
生物标志物
蛋白指纹图谱
表面增强激光解析电离飞行时间质谱
年,卷(期)
2007,(9)
所属期刊栏目
技术与方法
研究方向
页码范围
1632-1635
页数
4页
分类号
R73
字数
5432字
语种
中文
DOI
10.3321/j.issn:1673-8225.2007.09.011
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
姜泊
南方医科大学南方医院消化内科
161
1166
17.0
25.0
2
王继德
南方医科大学南方医院消化内科
48
262
10.0
13.0
3
吴保平
南方医科大学南方医院消化内科
18
82
5.0
8.0
4
李霆
南方医科大学南方医院消化内科
7
35
4.0
5.0
5
崔丹瑜
南方医科大学南方医院消化内科
6
21
3.0
4.0
传播情况
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引文网络
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蛋白指纹图谱
表面增强激光解析电离飞行时间质谱
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国组织工程研究
主办单位:
中国康复医学会
《中国组织工程研究与临床康复》杂志社
出版周期:
旬刊
ISSN:
2095-4344
CN:
21-1581/R
开本:
大16开
出版地:
沈阳浑南新区10002信箱
邮发代号:
8-584
创刊时间:
1997
语种:
chi
出版文献量(篇)
55677
总下载数(次)
80
总被引数(次)
337465
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