西瓜炭疽菌核糖体基因ITS区段的克隆及序列分析

• 作者: 唐建辉 王伟
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: Colletotrichum orbiculare 核糖体基因转录间隔区 聚类组
• 年，卷（期）: 2007,（9）
• 所属期刊栏目: 农业生物技术
• 页码范围: 2566-2568,2658
• 页数: 4页
• 分类号: Q785
• 字数: 2894字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2007.09.024

摘要

采用真菌核糖体基因转录间隔区域(ITS)通用引物,PCR扩增4个来自不同地方的西瓜炭疽病菌核糖体基因的ITS1和ITS2,并对PCR产物进行了克隆和序列分析.结果表明:西瓜炭疽病菌的ITS全长481 bp,其中ITS1长163 bp,5.8 S长153 bp,ITS2长165 bp,各碱基A、T、G、C的个数分别为110、106、118、147,GC含量为55.1%.用Mega3软件对此4个序列以及GeneBank中登录的炭疽属其他24个种的ITS1和ITS2聚类分析,结果显示:Colletotrichum 属可以分为13个聚类组,各聚类组间存在着一定的遗传多样性,其中Colletotrichum orbiculare、Colletotrichum lindemuthiana在ITS1、ITS2上都聚为一组,这就为用ITS作为靶序列来设计特异性引物将Colletotrichum orbiculare、Colletotrichum lindemuthiana与其他种分开提供了分子依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	唐建辉	生物反应器工程国家重点实验室华东理工大学生物工程学院	1	29	1.0	1.0
2	王伟	生物反应器工程国家重点实验室华东理工大学生物工程学院	1	29	1.0	1.0