电离辐射影响成纤维细胞基因调控网络的初步研究

• 作者: 商涛 廖之君 梁爽 董云巧 郑文岭 陈霞 马文丽
• 来源期刊: 热带医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 电离辐射 细胞凋亡 转录因子 转录因子结合位点 转录调控网络
• 年，卷（期）: 2008,（4）
• 所属期刊栏目: 硕博专栏论著
• 页码范围: 291-294
• 页数: 4页
• 分类号: R34
• 字数: 3554字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-3619.2008.04.003

摘要

目的 探讨电离辐射影响人成纤维细胞基因表达的转录调控机制,并构建基因与相应转录因子的调控网络.方法 先对前期研究已经获得的差异表达基因进行功能注释,选择结合功能类基因(数量最多)进人研究:再用MaxLAPS,TFME和SCOPE 3种软件预测这些基因的转录因子和转录因子结合位点;利用Bibliosphere软件构建转录因子与基因的转录调控网络.结果 获得25条Gene Symbols,基因本体功能注释集中于结合功能(共19条),2种程序预测得到14个相同的转录因子,得分最高的6个转录因子结合位点对应的转录因子与预测的基本一致.按照最高水平标准构建的转录调控网络,显示CASPASE-3位于网络的核心.结论 电离辐射很可能经转录因子TP53介导CASPASE-3激活而致人成纤维细胞凋亡.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马文丽	南方医科大学基因工程研究所	275	1255	15.0	23.0
2	廖之君	南方医科大学基因工程研究所	10	33	4.0	5.0
6	梁爽	南方医科大学基因工程研究所	18	75	5.0	7.0
7	陈霞	南方医科大学基因工程研究所	18	62	4.0	7.0
8	商涛	南方医科大学基因工程研究所	7	15	3.0	3.0
9	董云巧	南方医科大学基因工程研究所	3	9	1.0	3.0