基于支持向量机的大肠黏液腺癌术前血清蛋白质标志物检测及分析

• 作者: 余捷凯 张苏展 徐文鸿 王连聪 胡跃 郑树 陈益定
• 来源期刊: 细胞生物学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 大肠黏液腺癌 表面加强激光解吸电离-飞行时间质谱 生物信息学
• 年，卷（期）: 2008,（6）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 819-822
• 页数: 4页
• 分类号: R73
• 字数: 3058字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7666.2008.06.027

摘要

应用表面加强激光解吸电离-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术和CM10蛋白质芯片从大肠黏液腺癌和非黏液腺癌患者中成功地筛选出了大肠黏液腺癌患者血清特异性相关蛋白.应用美国CipherGen公司CM10蛋白质芯片和PBSⅡ型蛋白质芯片阅读仪检测53例大肠癌患者(黏液腺癌12例,非黏液腺癌41例)患者血清蛋白质指纹图谱.采用ZUCI-Protein Chip Data Analyze System分析软件包进行分析,离散小波去噪音,结合支持向量机筛选肿瘤标志物,建立大肠黏液腺癌的术前诊断模型.12例大肠黏液腺癌患者与41例大肠非黏液腺癌患者的血清蛋白质有12个蛋白质峰强度有显著差异.其中质荷比为24 297和23 434 m/z处的蛋白质峰强度统计学P值分别为0.0067和0.0092,差异有极显著统计学意义.支持向量机筛选出24 297、3 322、3 822和4 353 m/z蛋白质峰作为生物标志物进行检测和预测准确率,其中12例大肠黏液腺癌患者中有10例患者被正确识别,41例大肠癌非黏液腺癌患者中有39例被正确识别,准确率为92.45%(49/53).该方法可以较好地应用于区别大肠黏液腺癌和非黏液腺癌,进行术前病理鉴别,指导进行大肠黏液腺癌的手术和综合治疗.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑树	浙江大学医学院附属第二医院肿瘤研究所	227	2645	27.0	42.0
2	王连聪	浙江大学医学院附属第二医院肿瘤放疗科	21	102	5.0	9.0
3	张苏展	浙江大学医学院附属第二医院肿瘤研究所	80	800	13.0	25.0
4	余捷凯	浙江大学医学院附属第二医院肿瘤研究所	44	344	9.0	17.0
5	胡跃	浙江大学医学院附属第二医院肿瘤外科	12	130	5.0	11.0
6	陈益定	浙江大学医学院附属第二医院肿瘤外科	20	64	5.0	6.0
7	徐文鸿	浙江大学医学院附属第二医院肿瘤放疗科	3	4	1.0	1.0