节旋藻硝酸盐转运蛋白基因Amnrt P序列分析

• 作者: 凌娜 张学成 茅云翔 邵林 隋正红
• 来源期刊: 高技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 节旋藻 硝酸盐转运蛋白(NRT) 硝酸盐转运蛋白基因(AmnrtP) 序列分析 系统发育
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 所属期刊栏目: 资源环境与生物技术
• 页码范围: 97-103
• 页数: 7页
• 分类号: Q94
• 字数: 4103字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3772/j.issn.1002-0470.2008.01.018

摘要

应用生物信息学软件对获得的节旋藻硝酸盐转运蛋白基因(Amnrt P)全长序列进行了结构特征、同源性比较、多序列比对、系统发育学分析等.结果表明:该基因全长为1515 个核苷酸,编码 504 个氨基酸,平均 GC 含量为43.8%,疏水氨基酸的比例为47.6%.该硝酸盐转运蛋白含有 12 个跨膜结构域(Transmembrane domains,Tm),膜拓扑结构与 NRT2 家族的类似,并发现了多个 NRT2 家族的保守序列.同源性搜索显示与属于 NRT2 基因家族的海洋蓝藻的氨基酸序列相似性为75%～89%.采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)和最大似然法(ML)构建了分子系统树,结果表明 3 种树的拓扑结构基本相似,并且在蓝藻中基于硝酸盐转运蛋白基因的系统发育关系与形态学分类结果相一致.所获 Amnrt P 基因属于 NRT2 基因家族,可成为蓝藻系统进化研究的分子标记,并为了解节旋藻中硝酸盐吸收与转运的基因结构和分子机制奠定了一定的基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张学成	中国海洋大学海洋生命学院	122	1664	22.0	34.0
2	茅云翔	中国海洋大学海洋生命学院	39	535	10.0	22.0
3	凌娜	哈尔滨商业大学生命科学与环境科学研究中心	15	43	4.0	5.0
5	隋正红	中国海洋大学海洋生命学院	46	403	10.0	18.0
6	邵林	中国海洋大学海洋生命学院	3	8	2.0	2.0