毛果杨全基因组硝酸根转运蛋白家族(NRT2s)序列分析

• 作者: 李红 罗志斌 袁丁 郝文芳
• 来源期刊: 西北林学院学报
• 关键词: 氮素营养 硝酸根 转运蛋白 毛果杨 序列分析
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 所属期刊栏目: 林木遗传育种与培育
• 页码范围: 80-86
• 页数: 7页
• 分类号: S792.11
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-7461.2012.05.15

摘要

以拟南芥(Arabidopsis thaliana)和莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardttii)高亲和性硝酸根转运蛋白(NRT2s)为对照,对毛果杨(Populus trichocarpa)NRT2s家族成员进行序列比对、系统发育分析、基因结构分析、理化性质预测、疏水性与跨膜区预测、结构域检测等生物信息学分析.结果表明:毛果杨基因组包含6个NRT2s家族成员并可分为3个亚家族.其中PtNRT2.1、PtNRT2.2和PtNRT2.3属于亚家族Ⅰ;PtNRT2.4和PtNRT2.5属于亚家族Ⅱ; PtNRT2.6属于亚家族Ⅲ.亚家族Ⅰ保守程度最高,亚家族Ⅱ和Ⅲ可能由亚家族Ⅰ进化而来.所有的NRT2s都具有高度相似的结构域、功能区和基因结构,在不同物种中的进化较为保守.不同的NRT2s成员定位于不同的亚细胞结构中,其具体功能可能存在差异,并共同参与调控杨树的硝态氮平衡.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郝文芳	西北农林科技大学生命科学学院	50	1065	17.0	32.0
2	李红	西北农林科技大学植物保护学院	15	169	8.0	13.0
3	罗志斌	西北农林科技大学生命科学学院	7	73	4.0	7.0
7	袁丁	西北农林科技大学生命科学学院	2	20	2.0	2.0