毛果杨全基因组磷酸根转运蛋白家族成员序列分析

• 作者: 李红 王策 甘红豪 秦静静 罗志斌
• 来源期刊: 浙江农林大学学报
• 关键词: 生物化学 磷素 杨树 基因组 序列分析 生物信息
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 页码范围: 516-526
• 分类号: S718.3|Q51
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-0756.2012.04.006

摘要

磷酸根转运蛋白是一类主动转运磷酸根的重要载体蛋白.主要探讨毛果杨Populus trichocarpa全基因组中磷酸根转运蛋白(phosphate transporter)家族成员的系统发生和部分成员的理化性质、结构特点及亚细胞定位.以从毛果杨全基因组数据库中搜索并筛选得到的目标蛋白序列为基础,利用相关生物信息学软件对其进行系统发育分析,并利用一系列在线服务器对部分成员的理化参数、亲/疏水性、跨膜域、二级结构、三级结构和亚细胞定位进行了重点分析.结果表明,在毛果杨全基因组中共发现了31个磷酸根转运蛋白家族成员,根据其序列相似性,可分为4个亚家族,即PtrPHT1,PtrPHT2,PtrPHO1和PtrPHO2；PHT亚家族内的序列相似性高于PHO,并且高度保守；它们均为疏水性的全α型蛋白质,PHTs一般具有12个跨膜域,多于PHOs；不同亚家族成员的亚细胞定位不尽相同.因此,毛果杨磷酸根转运蛋白不同亚家族间分开较早,它们在杨树磷素代谢中可能起着不同的作用,共同维持并调控杨树体内的磷素平衡.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李红	西北农林科技大学植物保护学院	15	169	8.0	13.0
2	罗志斌	西北农林科技大学生命科学学院	7	73	4.0	7.0
6	王策	西北农林科技大学生命科学学院	1	11	1.0	1.0
7	秦静静	西北农林科技大学生命科学学院	1	11	1.0	1.0
8	甘红豪	西北农林科技大学生命科学学院	1	11	1.0	1.0