被子植物小热激蛋白家族的比较基因组学分析

• 作者: 范凯 叶方婷 毛志君 潘鑫峰 李兆伟 林文雄
• 来源期刊: 植物学报
• 关键词: sHSP家族 比较基因组学 扩增 基因表达
• 年，卷（期）: 2021,（null）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 245-261
• 页数: 16页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11983/CBB20209

摘要

小热激蛋白(sHSP)是一类重要的响应外界环境变化以及调控植物生长发育的蛋白家族。基于在睡莲(Nymphaea colorata)、水稻(Oryza sativa)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)和葡萄(Vitis vinifera)中分别鉴定到的33个NcsHSPs、24个OssHSPs、17个AtsHSPs和47个VvsHSPs，表明sHSP家族可分为12个亚家族，不同亚家族包含不同的sHSP成员数目、保守基序、基因结构以及复制基因数目。在4种模式被子植物的sHSP成员中共鉴定到12个基因复制事件，片段复制事件和串联复制事件均与sHSP成员的扩增有关，且片段复制事件发生的时间早于串联复制事件。在所有sHSP成员中，拟南芥和葡萄的sHSP成员的同源性最高，其次为睡莲和葡萄的sHSP成员。sHSP家族在被子植物中可能向更短的氨基酸长度、更小的分子量、更简单的基因结构以及更集中的染色体分布进化。此外，在睡莲、水稻、拟南芥和葡萄中鉴定了一些可能与调控植物生长发育相关的候选基因。研究结果为4种模式被子植物sHSP家族的比较基因组学研究奠定了重要基础，并为其它被子植物sHSP家族的研究提供重要参考。