用16S和23S rDNA基因芯片检测和鉴定临床常见感染性消化道病原菌

• 作者: 吴晓芳 姚丽惠 张甦 张红河 李刚 毕丹 沈翠芬 邢建明
• 来源期刊: 浙江检验医学
• 学科: 医学
• 关键词: 寡核苷酸芯片 病原菌 检测
• 年，卷（期）: 2008,（3）
• 页码范围: 32-35
• 页数: 4页
• 分类号: R450

摘要

目的以细菌16S rDNA和23Sr DNA基因为靶序列,建立可检测临床7种常见病原菌寡核苷酸芯片系统。方法采用双重PCR扩增标本中靶细菌16S rDNA和23S rDNA基因片段。构建能同时检测肠出血性大肠埃希菌O157:H7、副溶血性弧菌、沙门菌、霍乱弧菌、产单核李斯特菌、空肠弯曲菌和志贺菌的寡核苷酸芯片,并考核芯片的检测特异性、灵敏度和重复性。采用所建立的寡核苷酸芯片检测81例腹泻和呕吐病人粪便样本。结果双重PCR可同时扩增上述7种病原菌的16S rDNA和23S rDNA基因靶序列。所研制的寡核苷酸芯片检测灵敏度可达103cfu/ml,非靶细菌无阳性结果,不同批间和批内芯片的变异系数为3.89%～5.81%。寡核苷酸芯片检测粪便样本的阳性率为39.5%(32/81),与常规细菌学检查法检测结果的一致率达到96.3%(78/81),菌种鉴定结果一致率为96.8%(31/32)。结论本研究中建立的寡核苷酸芯片法在检测上述7种病原菌时,具有简便、快速、准确、稳定、高通量等优点,适合于临床样本检测及流行病学的现场调查。