近全长序列分析HIV-1独特型CRF01_AE/B'重组病毒基因

• 作者: 周磊明 康来仪 戚中田 杨洋 潘启超 薛以乐 钟平
• 来源期刊: 诊断学理论与实践
• 学科: 医学
• 关键词: 人免疫缺陷病毒Ⅰ型 基因亚型 重组 近全长序列分析
• 年，卷（期）: 2008,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 511-516
• 页数: 6页
• 分类号: R512.91
• 字数: 3576字
• 语种: 中文

摘要

目的:对上海市发现的1例独特类型的CRF01_AE/B'重组病毒株进行近全长序列分析,以了解其DNA序列的特征.方法:应用巢式逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法,分段扩增HIV-1近全长基因组相应片段,进行克隆、测序,并分析其遗传进化树和序列断点位置.结果:近全长序列分析提示,该患者所感染的病毒由CRF01_AE和HIV-1B'亚型嵌合组成,两者各占约50%.其多聚酶蛋白基因(Pol)和外膜糖蛋白基因(Env)区均有HIV-1B'亚型片段和CRF01_AE片段嵌合组成.2种亚型病毒DNA片段嵌合点的位置与过去报道的重组病毒株(CRF15-AE/B、CRF33_AEfB和CRF34_AE/B)均不同.结论:在我国常见流行的HIV-1 CRF01_AE重组病毒与B'亚型已在HIV-1感染人群中发生重组,其可能是在我国散发流行的独特型重组病毒株.