H5N1禽流感病毒血凝素基因密码子的变异

• 作者: Mark J Gibbs Robert W Murphv 于广福 史卫峰 庄东明 张彦周 朱朝东 杨娜娜 顿爱社
• 来源期刊: 中国科学C辑
• 关键词: 正选择压力 H5N1 禽流感病毒 血凝素 密码子
• 年，卷（期）: 2008,（10）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 949-955
• 页数: 7页
• 语种: 中文

摘要

应用固定效应似然模型研究了作用于H5N1禽流感病毒血凝素基因的选择压力.研究发现,除2000年以外,1997～2007年,H5N1病毒的血凝素基因都受到正选择压力的作用.东南亚、中国香港和中国大陆的血凝素序列氨基酸多态性最复杂,并且具有相似的非同义突变模式.大部分地区的H5N1病毒血凝素基因的一些位点受到正选择压力的影响,并且其中一些位点在不同地区的病毒中具有不同的氨基酸模式.另外,正选择压力对分离自欧洲、非洲和俄罗斯以及不同宿主类型的H5N1病毒产生了不同的影响.一个位点只在取自人类的病毒中被发现受到正选择压力的影响.尽管一些受到正选择压力的位点的功能尚不清楚,但是本文的分析提供了H5N1禽流感病毒适应不同时间、地点和寄主的遗传证据.