青石斑鱼微卫星DNA标记的筛选及群体遗传多样性分析

• 作者: 刘丽 刘楚吾 徐田军 董秋芬 郭昱嵩
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 青石斑鱼 基因组文库 PCR法 微卫星标记 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 22-29
• 页数: 8页
• 分类号: Q959.483
• 字数: 5528字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2008.01.003

摘要

以中国南海海域青石斑鱼(Epinephelus awoara)为材料,构建青石斑鱼小片段部分基因组DNA文库.以M13通用引物和设计合成的微卫星核心序列引物(CA)15,用PCR法对文库进行筛选,共获得96个微卫星序列,分别分布于28个阳性重组克隆中,其中perfect(完美型)共39个(占40.6%),imperfect(非完美型)30个(占31.3%),compound perfect(混合完美型)7个(占7.3%),compound imperfect(混合非完美型)20个(占20.8%).同时发现(CA/GT)n序列在青石斑鱼的基因组DNA中含量非常丰富.根据微卫星侧翼序列设计28对引物扩增青石斑鱼基因组DNA,有26对引物能扩增出目的片段,选用其中13对多态性稳定的引物对19尾青石斑鱼进行遗传多样性分析.结果显示,13个位点共检测到48个等位基因,平均观测杂合度(Ho)为0.598 2,平均期望杂合度(He)为0.508 0,平均多态信息含量(PIC)为0.472 2,平均Hardy-Weinberg遗传偏离指数(D)为0.150 3.实验初步表明中国南海海域青石斑鱼的遗传多样性较为丰富,但在某种程度上受到了人为的干扰.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘楚吾	广东海洋大学水产学院	105	1315	18.0	30.0
2	郭昱嵩	广东海洋大学水产学院	34	378	9.0	18.0
3	刘丽	广东海洋大学水产学院	70	595	13.0	21.0
4	董秋芬	广东海洋大学水产学院	5	191	5.0	5.0
5	徐田军	广东海洋大学水产学院	5	137	4.0	5.0