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新疆两湖细菌的非培多样性研究
新疆两湖细菌的非培多样性研究
作者:
史锋
吴敏
孙超
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
新疆
16S rDNA文库
系统发育分析
多样性
摘要:
采用非培的方法对新疆销库尔成湖和兔子湖的细菌多样性进行研究,通过细菌的16S rDNA通用引物PCR扩增其16S rRNA基因序列并构建16S rDNA文库,每个湖随机抽取32个克隆子进行测序,借助系统发育分析软件对获得的序列进行分析;同时通过多样性指数、丰富度指数和优势度指数对两个湖的细菌多样性进行了比较分析.研究结果表明同销库尔成湖的细菌文库相似的微生物属于以下六大细菌类群:变形细菌门(Proteobactcte-ria)34.5%,包括α-proteobacteria、β-proteobacteria和γ-proteobacteria三个纲,拟杆菌门(Bacteroidetes)27.6%,壁厚菌门(Firmicutes)24.1%,绿菌门(Chlorobi)3.4%,疣微菌门(Verrucomicrobia)3.4%和未分类细菌(unclassified)6.9%;而与兔子湖的细菌文库相似的微生物则分为以下七大类:变形细菌门(Proteobacteria)51.90%,包括β-pro-teobacteria、γ-proteobacteria和δ-proteobacteria,拟杆菌门(Bacteroidetes)7.40%、壁厚菌门(Firmicutes)22.2%、酸杆菌门(Acidobacteria)3.70%、放线菌门(Actinobacteria)3.70%、浮霉菌门(Planctomycetes)3.70%和未分类细菌(Unclassified)7.40%.最后两湖的各种多样性指数的比较结果表明兔子湖的细菌多样性和丰富度均比销库尔咸湖大,这也充分显示了新疆地区的湖泊具有丰富的微生物多样性,值得进一步深入研究.
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文献信息
篇名
新疆两湖细菌的非培多样性研究
来源期刊
浙江大学学报(理学版)
学科
生物学
关键词
新疆
16S rDNA文库
系统发育分析
多样性
年,卷(期)
2008,(4)
所属期刊栏目
生命科学
研究方向
页码范围
448-454,459
页数
8页
分类号
Q93
字数
4327字
语种
中文
DOI
10.3785/j.issn.1008-9497.2008.04.020
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
吴敏
浙江大学生命科学学院
86
737
15.0
24.0
2
史锋
浙江大学生命科学学院
28
400
12.0
19.0
3
孙超
浙江大学生命科学学院
13
85
5.0
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浙江大学学报(理学版)
主办单位:
浙江大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1008-9497
CN:
33-1246/N
开本:
大16开
出版地:
杭州市天目山路148号浙江大学
邮发代号:
32-36
创刊时间:
1956
语种:
chi
出版文献量(篇)
3051
总下载数(次)
2
总被引数(次)
24460
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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