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滴水湖表层水体细菌多样性特点初步探究
滴水湖表层水体细菌多样性特点初步探究
作者:
王永杰
黎谢飞
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
16S rRNA基因
变性梯度凝胶电泳
宏基因组
滴水湖表层水体
细菌多样性
水体污染菌
摘要:
上海市浦东新区滴水湖自建成后,围绕滴水湖水体质量的研究很多,但是滴水湖水体总体细菌多样性特点的研究尚未见报道.本研究结合16S rRNA基因变性梯度凝胶电泳、16S rRNA基因宏基因组学分析的方法来初步探究滴水湖表层水体细菌的多样性特点,以及滴水湖中粪便污染指示菌、致病菌、条件致病菌和水体富营养化典型菌等的存在性和分布情况.研究结果可以说明滴水湖表层水体在采样期内的细菌多样性:(1)5个水体样品共获得428个OTU,属于17个细菌门,39个纲,81个目,130个科,191个属,282个种.(2)湖水中以放线菌门(Actinobacteria)、蓝藻门(Cyanobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、浮霉菌门(Planctomycetes)为优势门,占总序列数的97%.(3)在宏基因组中没有检测到水体粪便污染指示菌等相关的序列,在属的水平没有发现沙门氏菌属(Salmonella)、链球菌属(Streptococcus)等致病菌或条件致病菌,只有极少量的序列属于志贺氏菌属(Shigella,0.1%).滴水湖表层水体中蓝藻主要为聚球藻属(Synechococcus),没有发现富营养化水体中容易出现的水华蓝藻的序列.可知滴水湖表层水体的细菌多样性特点与淡水湖泊典型细菌多样性特点类似,湖水中没有检出水体污染菌,目前也没有证据表明有蓝藻暴发导致水华的倾向.
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文献信息
篇名
滴水湖表层水体细菌多样性特点初步探究
来源期刊
上海海洋大学学报
学科
地球科学
关键词
16S rRNA基因
变性梯度凝胶电泳
宏基因组
滴水湖表层水体
细菌多样性
水体污染菌
年,卷(期)
2018,(5)
所属期刊栏目
水域环境与保护
研究方向
页码范围
728-738
页数
11页
分类号
X172
字数
语种
中文
DOI
10.12024/jsou.20180102197
五维指标
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上海海洋大学学报
主办单位:
上海水产大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1004-7271
CN:
31-2024/S
开本:
大16开
出版地:
上海市军工路334号
邮发代号:
4-604
创刊时间:
1992
语种:
chi
出版文献量(篇)
2427
总下载数(次)
5
总被引数(次)
28460
相关基金
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英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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