硬粒小麦基因组中硒蛋白存在性分析研究

• 作者: 何光源 杨广笑 肖庆
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 生物学
• 关键词: 硒蛋白 SECIS 硬粒小麦
• 年，卷（期）: 2008,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 23-26
• 页数: 4页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 3258字
• 语种: 中文

摘要

目的:用生物信息的方法对硬粒小麦基因组中硒蛋白存在性进行分析研究.方法:利用SECISearch工具将Genebank中收录的11 029条硬粒小麦核酸序列逐个分析,找出具有符合硒蛋白特有茎环结构的序列,以已经发表的衣藻中硒蛋白为参照对象,利用Vector NTI软件对匹配序列进行生物信息分析,研究硬粒小麦硒蛋白存在性.结果:发现AY146587.1序列的互补序列中存在一个表达区与衣藻硒蛋白具有较高的结构相似性(该序列区长度为288bp,对应的SECIS在其下游6 071bp处),很有可能是硬粒小麦硒蛋白(或同源蛋白)编码区.结论:获得硬粒小麦中可能与硒蛋白相关的核酸序列.