甘蓝型油菜每角粒数的全基因组关联分析

• 作者: 孙程明 陈锋 陈松 彭琦 张维 易 斌 张洁夫 傅廷栋
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 甘蓝型油菜 产量 每角粒数 关联分析 SNP标记
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 147-153
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2020.94060

摘要

每角粒数是油菜重要的产量构成因子, 增加每角粒数有助于提高油菜的籽粒产量。利用Illumina 60K SNP芯片对496份具有代表性的油菜资源进行基因型分析, 考察该群体在2个环境中的每角粒数, 利用MLM和GLM模型进行全基因组关联分析。结果表明, 本群体在2个环境中每角粒数的广义遗传力为57.7%。利用MLM和GLM模型分别检测到9个和20个位点, 所有MLM位点均得到GLM结果的验证。6个位点与前人定位的QTL重叠, 其中2个位点得到2次验证, 其余14个是新位点。在7个位点附近找到了候选基因, 其中在C09染色体的位点Bn-scaff_15576_1-p74980附近找到已克隆的油菜每角粒数基因BnaC9.SMG7b, 在其余6个位点附近找到GRDP1、SPATULA、HVA22D、DA2等已知的拟南芥每角粒数基因的同源基因。本研究结果有助于解析油菜每角粒数的遗传基础及其调控机制, 为每角粒数的遗传改良奠定了基础。