砷胁迫下甘蓝型油菜苗期根、下胚轴和鲜重的全基因组关联分析

• 作者: 曲存民 马国强 朱美晨 黄小虎 贾乐东 王书贤 赵会彦 徐新福 卢坤 李加纳 王瑞
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 甘蓝型油菜 耐砷性 全基因组关联分析 候选基因
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 175-187
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2019.84093

摘要

油菜是修复土壤重金属污染的理想作物，为筛选甘蓝型油菜耐砷性的显著关联单核苷酸多态性位点及相关候选基因，本研究以140份不同来源的甘蓝型油菜自交系为材料，测定和利用油菜60KSNP芯片对正常和砷胁迫条件下的相对根长(RRL)、相对下胚轴长(RHL)和相对鲜重(RFW)进行了全基因组关联分析。结果表明，与RRL、RHL和RFW显著关联的SNP位点分别为15、20和35个，单个SNP位点表型贡献率分别介于13.31%~24.39%、18.04%~33.82%和20.19%~25.06%之间;其中在A02、A07和C02染色体上同时存在与RRL、RHL和RFW显著关联的LD区间。基于油菜基因组信息在LD区间内共筛选到61个可能与砷胁迫相关的候选基因，其中PHT3;3、PHT1;9、GST、OTC5、NRAMP1和ZIP12等与重金属吸收和转运相关。实时荧光定量PCR分析结果表明，PHT3;3和PHT1;9是与甘蓝型油菜砷离子吸收转运相关的重要候选基因。本研究结果对于甘蓝型油菜耐砷胁迫机理的研究、性状的改良具有重要参考价值。