甘蓝型油菜角果长度性状的全基因组关联分析

• 作者: 孙程明 陈松 彭琦 张维 易斌 张洁夫 傅廷栋
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 甘蓝型油菜 产量 角果长度 关联分析 SNP标记
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1303-1310
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2019.94021

摘要

角果长度是油菜重要的农艺性状，适度增加角果长度有利于扩大角果库容量，增加光合面积，提高油菜的籽粒产量。本研究利用Illumina60KSNP芯片对496份具有代表性的油菜资源进行基因型分析，考察群体在4个环境中的角果长度表型，利用MLM和GLM模型进行全基因组关联分析。结果表明，MLM模型检测到7个位点，联合解释25.01%的表型变异;GLM模型检测到25个位点，联合解释41.77%的表型变异。合并共同位点后得到27个位点，其中7个与前人报道的QTL重叠，其余20个是新鉴定的位点。效应最大的位点Bn-A09-p29991443位于A09染色体，在MLM和GLM模型中分别解释13.89%和12.86%的表型变异，携带其优异等位基因的材料平均角果长度增加0.89cm。同时，在该位点附近找到已克隆的油菜角果长度基因ARF18和BnaA9.CYP78A9。此外，在5个位点附近发现拟南芥已知角果长度基因GID1b、FUL、EOD3、DOF4.4和GA20ox1的同源拷贝。本研究结果有助于解析角果长度的遗传基础，为研究角果长度的调控机理，指导角果长度的遗传改良打下基础。