湖泊沉积物中DNA提取与PCR扩增

• 作者: 李世杰 申慧彦
• 来源期刊: 地球科学进展
• 关键词: 湖泊沉积物 微囊藻 DNA提取 PCR扩增
• 年，卷（期）: 2008,（4）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 433-438
• 页数: 6页
• 分类号: P512.2|Q343.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1001-8166.2008.04.014

摘要

对湖泊沉积物中保存的生物大分子-DNA进行研究分析,以探讨湖泊生态系统随环境改变而演变的过程.根据前人对土壤和海洋沉积物DNA的提取方法,针对湖泊沉积物的特点进行改进,在此基础上对太湖梅梁湾湖泊沉积岩芯进行DNA提取和扩增.结果表明:不同深度湖泊沉积物均能获得DNA,且纯度较高,OD260/OD280均大于1.4、OD260/OD230大于1.1,可直接用于PCR(polymerase chain reaction)扩增.对微裳藻的16S rRNA基因进行PCR扩增,结果发现在前5个沉积物样品中,均得到了200 bp左右的微囊藻16S rRNA基因片段,表明微囊藻或已降解的微囊藻基因片段存在于这5个层位的湖泊沉积物中.这为利用湖泊沉积物中的生物分子来推断历史湖泊生物群落结构,判断湖泊生态演变的历史提供了新的研究思路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李世杰	中国科学院南京地理与湖泊研究所湖泊与环境国家重点实验室	74	2134	28.0	45.0
2	申慧彦	中国科学院南京地理与湖泊研究所湖泊与环境国家重点实验室	4	92	4.0	4.0