应用GINI检出微卫星不稳定型大肠癌中新的突变基因

• 作者: Claudine Navarro Jessie Auclair 徐晓丽 施达仁 汪清
• 来源期刊: 复旦学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: NMD抑制 大肠癌 微卫星不稳 突变
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 58-62
• 页数: 5页
• 分类号: R735.3+4
• 字数: 3811字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-8467.2008.01.012

摘要

目的 应用GINI筛选微卫星不稳定型大肠癌中新的突变基因.方法 采用NMD抑制药物emetine(依米丁)联合actmomycin D(放线菌素D),分别处理高度微卫星不稳定型(MSI-H)大肠癌细胞株HCT116和微卫星稳定(MSS)的大肠癌细胞株HT29,以及对照的MSS乳腺癌细胞株,以全基因组cDNA芯片检测经药物处理和不经药物处理的细胞株的mRNA表达变化.经过芯片数据分析筛选在HCT116细胞中mRNA表达量特异性升高的基因,以DNA直接测序法检测突变,并在22个大肠癌细胞株及30例原发癌组织中验证.结果 在MSI-H大肠癌细胞株HCT116中筛选出新的突变基因ARV1和ZNF294,并在8个MSI-H细胞株中验证其突变率分别为37.5%和87.5%,在20例MSI-H原发大肠癌组织中突变率均为35%.结论 基于NMD抑制的新的基因筛选方法GINI,能够相对快速、有效的检出发生突变的基因.