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摘要:
目的 建立简单、高效的DNA甲基化标记和SNPs联合检测技术,并用于H19基因上游高甲基化区两组SNPs群体遗传学检测.方法 用PCR-DGGE技术对232例武汉汉族无关个体H19基因上游启动子区H19FR1和H19FR2单倍型进行检测;同时选用两种甲基化敏感的限制酶(msRE)Hpa Ⅱ和Hha Ⅰ,检测H19FR等位基因亲代来源.结果 H19FR1区检出5种单倍型、9种表型组合,其个体识别能力(DP)、多态性信息含量(PIC)和非父排除率(PE)分别为0.803、0.58和0.322;H19FR2区检出2种单倍型、3种表型组合,其DP、PIC和PE值分别为0.626、0.37和0.162.测序结果 显示,片段H19FR1含有a7342g、a7357g和g7547a 3个SNPs与1个g7351c点突变;H19FR2仅含a8097g 1个SNP.msRE Hpa Ⅱ或Hha Ⅰ可消化个体母源等位基因,PDP-DGGE分析仅能检测到父源等位基因.结论 PDP-DGGE是一种简单、灵敏、高效的DNA甲基化标记和SNPs联合分析技术,其在进行多态性分型同时还可以确定等位基因的亲代来源,具有较高的法医学应用价值.
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文献信息
篇名 印记基因H19上游高甲基化区SNPs多态性研究
来源期刊 中国法医学杂志 学科 政治法律
关键词 法医物证学 印记基因 SNP 聚合酶链反应 变性梯度凝胶电泳 甲基化敏感的限制酶
年,卷(期) 2008,(5) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 302-305,308
页数 5页 分类号 D9
字数 3124字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1001-5728.2008.05.005
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 黄代新 华中科技大学同济医学院法医学系 64 409 9.0 17.0
2 杨庆恩 华中科技大学同济医学院法医学系 64 533 11.0 20.0
3 翟仙敦 华中科技大学同济医学院法医学系 11 91 5.0 9.0
4 林晓燕 华中科技大学同济医学院法医学系 3 21 3.0 3.0
8 林宇新 华中科技大学同济医学院法医学系 3 17 2.0 3.0
9 李小廷 华中科技大学同济医学院法医学系 5 25 3.0 5.0
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SNP
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变性梯度凝胶电泳
甲基化敏感的限制酶
研究起点
研究来源
研究分支
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国法医学杂志
双月刊
1001-5728
11-1721/R
大16开
北京西城区木樨地南里17号楼303室
1986
chi
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5
总被引数(次)
14216
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