GEO-基因表达综合数据库的应用与数据挖掘

• 作者: 郑文岭 阴常欣 马文丽
• 来源期刊: 医学分子生物学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 基因表达综合数据库 基因表达 数据挖掘
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 161-166
• 页数: 6页
• 分类号: Q7
• 字数: 4660字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3870/j.issn.1672-8009.2009.02.015

摘要

高通量微阵列杂交技术和测序技术的快速发展,产生了大量的基因数据,生物信息迅速膨胀成为数据的海洋.为适应这种高通量基因表达数据的不断增长和人们共享数据的需要,各种数据库应用而生,其中,NCBI (national center for biotechnology information)的基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)是世界上最大的储存高通量分子丰度数据的公共数据库,用户可以提交、储存和检索多种形式的数据并免费使用.迄今为止,GEO已收录了300000个样本的数据,涉及16亿个基因表达丰度数据,涵盖500多种生物体,广泛覆盖各种生物学内容.GEO数据库操作简单,数据全面,免费共享的优势为后期数据挖掘和信息推广提供了良好的平台.文章概述了GEO数据库的结构、数据的提交、检索和其在分子生物学领域中的应用前景.登陆GEO数据库的网址为:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马文丽	南方医科大学基因工程研究所	275	1255	15.0	23.0
2	阴常欣	南方医科大学基因工程研究所	15	50	3.0	6.0
3	郑文岭	南方医科大学基因工程研究所	121	603	11.0	20.0