玉米大斑病抗性基因Ht1定位区域内候选序列的生物信息学分析

• 作者: 崔娜 张春宇 林凤 许玉凤 鄂洋
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米大斑病 候选序列 抗性基因
• 年，卷（期）: 2009,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 638-644
• 页数: 7页
• 分类号: S4
• 字数: 4660字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2009.00638

摘要

为获得玉米大斑病抗性基因Ht1候选序列,文章采用生物信息学方法对与玉米大斑病抗性基因Ht1紧密连锁的分子标记umc22和umc122定位区域内候选序列进行了分析,其中得到的63条ORF序列中有14条序列可编码蛋白质结构域.将14条核苷酸酸序列预测出的氨基酸序列与已克隆的24条抗性基因编码氨基酸序列进行Blast比对及进化树构建.结果发现,候选序列gpm565a具有植物抗性基因编码产物的高度保守结构域,而且与抗性基因Xal相似性高、亲缘关系近,推测可能与抗性基因Ht1有关.其他候选序列由于不具有植物抗性基因编码产物的高度保守结构域或者相似性低,亲缘关系远等原因,不能确定与抗性基因Ht1有关.通过对候选序列gpm565a进行二级结构及三维结构分析,发现有大量构成蛋白质特异功能结构组件的无规则卷曲存在,推测gpm565a可能是Ht1功能域的一部分.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林凤	沈阳农业大学生物科学技术学院	47	584	14.0	22.0
2	许玉凤	沈阳农业大学生物科学技术学院	43	506	14.0	21.0
3	张春宇	沈阳农业大学生物科学技术学院	25	274	10.0	16.0
4	崔娜	沈阳农业大学生物科学技术学院	45	428	12.0	20.0
5	鄂洋	沈阳农业大学生物科学技术学院	8	31	4.0	5.0