玉米大斑病菌全基因组候选效应分子的预测和分析

• 作者: 肖淑芹 薛春生 闫丽斌
• 来源期刊: 沈阳农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米大斑病菌 候选效应分子 全基因组 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 15-20
• 页数: 6页
• 分类号: S432.1
• 字数: 5322字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-1700.2017.01.003

摘要

大斑病是一种世界性玉米叶部病害,可造成玉米产量严重降低,其致病菌大斑刚毛座腔菌(Setosphaeria turcica)可在叶片形成坏死斑,影响玉米品质并造成严重经济损失.效应分子在植物病原真菌对植物侵染过程中发挥着重要作用.根据玉米大斑病菌Et28A菌株全基因组信息,利用SignalP、TMHMM、Protcomp、big-PI Predictor和TargetP生物信息学软件和预测程序对玉米大斑病菌中11698条蛋白序列进行候选效应分子预测,再通过对上述蛋白半胱氨酸含量、信号肽长度及冗余性分析,获得60个符合条件的候选效应分子,其中大部分为功能未知的假定蛋白.利用生物信息学方法预测出玉米大斑病菌的候选效应分子,为进一步研究效应分子在病原菌与玉米互作中的作用奠定了基础,并为其他病原菌效应分子的预测及分析提供了参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	薛春生	沈阳农业大学植物保护学院	49	553	11.0	22.0
2	肖淑芹	沈阳农业大学植物保护学院	25	172	7.0	12.0
3	闫丽斌	沈阳农业大学植物保护学院	2	14	2.0	2.0