尼罗罗非鱼Dmrt基因的序列分析

• 作者: 余来宁 刘红艳 张繁荣 杨东
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 尼罗罗非鱼 DmDmrt SSCP RACE
• 年，卷（期）: 2009,（3）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医·水产养殖
• 页码范围: 587-591
• 页数: 5页
• 分类号: Q781
• 字数: 3098字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2009.03.030

摘要

参照不同物种DM结构域设计了1对兼并引物,扩增出1条带,长约150 bp.对扩增产物进行克隆,阳性克隆采用SSCP 分析筛选不同基因片段,进一步对筛选的不同基因进行了 DNA 测序.结果获得2个不同的DmDmrt基因,采用 BLAST 方法与人类相应DmDmrt基因进行序列比对,发现其与人类相应的DmDmrt基因的氨基酸序列一致性分别为89.1% 和100.0%.根据尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)的拉丁文名,按习惯将其命名为OnDmDmrt1和OnDmDmrt2.根据扩增出的DmDmrt1 DM-domain的序列设计上游引物,用3′RACE(rapid amplification of cDNA ends) 法分离和测定了DmDmrt1 cDNA的3′序列,得到1 108 bp的片段,共编码262个氨基酸,与奥利亚罗非鱼、虹鳟、新月鱼、青鳉等动物的DmDmrt1的氨基酸序列进行比较,同源性分别为99%、62%、73%和41%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨东	江汉大学生命科学学院	30	179	7.0	12.0
2	余来宁	江汉大学生命科学学院	29	304	10.0	17.0
3	刘红艳	江汉大学生命科学学院	50	326	11.0	15.0
4	张繁荣	江汉大学生命科学学院	33	168	7.0	11.0