毛偃麦草Na+/H+逆向转运蛋白的分子克隆及生物信息学分析

• 作者: 关宁 李聪 王涌鑫 苗丽宏
• 来源期刊: 分子植物育种
• 学科: 生物学
• 关键词: 毛偃麦草 Na+/H+逆向转运蛋白 生物信息学
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 新基因、新种质、新品种
• 页码范围: 169-176
• 页数: 8页
• 分类号: Q94
• 字数: 4481字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-416X.2009.01.028

摘要

根据小麦和长穗偃麦草的液泡膜Na+/H+逆转运蛋白基因(TaNHX1、TeNHX1)全长序列设计引物,通过RT.PCR直接扩增的方法从毛偃麦草(Elytrigia trichophora L.)中克隆到了Na+/H+逆转运蛋白基因,命名为EtNHX1 (Accession numeber:EU876834).EtNHX1最大开放阅读框为1 641 bp,编码含有546个氨基酸残基、分子量为59.8 kD的蛋白,预测等电点8.0.EtNHX1含有39个碱性氨基酸,37个酸性氨基酸,256个疏水氨基酸及128个极性氨基酸.二级结构预测表明该蛋白含约47%的α-螺旋、20%的延伸链、4.5%的β-转角和28%的不规则卷曲.亲疏水性分析显示,EtNHXl含有12个连续的疏水片断,其中10个可能构成跨膜螺旋.序列分析显示,EtNHX1与小麦(Triticum aestivum L.)、中间偃麦草(Thinopyrum intermedium L.)、长穗偃麦草(Elytrigia elongate L.)、水稻(Oryza sativa L.)、角果碱蓬(Suaeaa corniculata L.)、小盐芥(Thellungiella halophila L.)等植物的液泡膜Na+/H+逆向转运蛋白高度同源,序列相似性分别为98%、98%、96%、85%、68%和67%.序比对结果以及进化树分析均表明EtNHX1应为定位于毛偃麦草液胞膜上的Na+/H+逆向转运蛋白.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李聪	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所牧草遗传育种研究室	45	378	11.0	17.0
2	苗丽宏	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所牧草遗传育种研究室	27	171	8.0	11.0
3	王涌鑫	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所牧草遗传育种研究室	14	115	5.0	10.0
4	关宁	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所牧草遗传育种研究室	9	173	6.0	9.0