基因芯片筛选食管鳞癌患者癌及癌旁组织差异表达基因

• 作者: 姜玉章 孙苏安 熊化生 郭伟
• 来源期刊: 肿瘤防治研究
• 学科: 医学
• 关键词: 食管鳞癌(ESCC) 基因表达谱 基因芯片
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 17-20
• 页数: 4页
• 分类号: R735.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3971/j.issn.1000-8578.2009.01.005

摘要

目的 探讨食管鳞癌(ESCC)患者癌组织基因表达谱.方法 取3例无ESCC家族史的癌及癌旁组织等量混合,抽提RNA,将RNA逆转录合成相应cDNA,以Cy5和Cy3标记cDNA作为探针,在含有14 000点人类基因组芯片(BiostarH-140s)上进行杂交.用Scanarray 4000扫描仪扫描芯片荧光信号图像,用GenePix Pro 3.0软件对扫描图像进行数字化处理和分析.结果 依Ratio(cy5/cy3)>2.0或<0.5的数据项为差异表达的基因共1 855个.含表达序列标签(EST)844个,下调基因378个,上调基因466个.在1 011个已知功能的基因中,下调基因560个,上调基因451个.包含各类功能基因.同时与6例具有家族史ESCC组织差异基因进行了初步分析.经与NCBI基因库比对,有8个基因相同,且异常表达这与报道相符.结论 基因芯片是一高效筛选食管癌相关基因的方法.在ESCC的发生、发展中存在着大量异常表达基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭伟	南京医科大学附属淮安市第一医院心胸外科	55	318	10.0	15.0
2	孙苏安	南京医科大学附属淮安市第一医院病理科	27	69	5.0	7.0
3	姜玉章	南京医科大学附属淮安市第一医院检验科	46	188	8.0	11.0
4	熊化生	南京医科大学附属淮安市第一医院心胸外科	7	21	3.0	4.0