胃癌基因表达谱和蛋白质表达谱的分析研究

• 作者: 刘炳亚 唐凯玲 张庆华 张晓青 朱正纲 李建芳 李炜 杨燕青 陈雪华
• 来源期刊: 中华胃肠外科杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 胃肿瘤 基因组 DNA微阵列 蛋白质组 电泳,凝胶,双向
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 52-56
• 页数: 5页
• 分类号: R73
• 字数: 3092字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1671-0274.2009.01.018

摘要

目的 从转录组水平和蛋白质组水平寻找胃癌组织与正常胃组织间的差异表达基因和蛋白.方法 应用含有14592个已知基因及表达序列标签的cDNA表达谱芯片获取基因表达谱信息,50%以上样本中Cy3/Cy5荧光强度比大于或等于2和小于或等于0.5的基因分别为在胃癌中表达上调或下调的基因.采用双向凝胶电泳(2-DE)分离32例经手术切除的胃癌患者的胃癌组织和正常胃组织总蛋白.对差异表达蛋白质点利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)进行分析.获取肽质量指纹图谱(PMF).同时搜索SWISS-PROT数据库鉴定蛋白质.结果 与正常组织相比.胃癌组织巾差异表达基因共有387个.其中表达上调的有149个基因,上调超过3倍的有29个基因;表达下调的有238个基因,其中下调超过5倍的有21个基因.在蛋白质水平鉴定了15个差异表达蛋白.在肿瘤组织中高表达的有10个.其余5个在肿瘤组织中低表达.胃癌中过表达的基因与蛋白产物主要与细胞骨架运动、细胞增殖及信号传导有关.表达下调的则主要与细胞免疫防御、毒理代谢有关.结论 从转录组水平和蛋白质组水平对胃癌基因表达谱进行分析.不仅有助于从分子水平全方位理解胃癌的发病机制及生物学特性.同时也有助于进一步发现新的胃癌相关标志物和基因治疗的靶点.