不同生境放线菌的卤化酶基因分析及其对卤代产物筛选的意义

• 作者: 朴玉华 郗丽君 阮继生 高鹏 黄英
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 卤化酶 基因筛选 海洋放线菌 陆地放线菌 链霉菌 小单孢菌
• 年，卷（期）: 2009,（10）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1367-1373
• 分类号: Q938
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0001-6209.2009.10.008

摘要

[目的]在基因水平上分析并比较陆地来源与海洋来源的放线菌产生卤化代谢产物的潜力.[方法]基于依赖黄素腺嘌呤二核苷酸的卤化酶基因筛选,从经过表型去重复的70株陆地来源和71株海洋来源的放线菌中,通过PCR筛选获得卤化酶基因片段,并进行测序鉴定;通过卤化酶氨基酸序列的系统发育分析,比较不同来源放线菌的卤化酶序列,以及海洋链霉菌和小单孢菌的卤化酶序列.另外,对卤化酶阳性菌株进行了聚酮合酶和非核糖体多肽合成酶基因的检测.[结果]本研究中36.6%的海洋放线菌具有卤化酶基因,其阳性率远高于本研究所涉及的陆地放线菌(14.3%);其中海洋链霉菌的卤化酶基因阳性率高达69.0%,而海洋小单孢菌的卤化酶阳性率仅为14.3%.86.1%的卤化酶阳性菌株具有聚酮合酶和/或非核糖体多肽合成酶基因.本研究获得的海洋来源的卤化酶序列与已知的卤化酶序列存在明显差异,在进化树上形成几个新的分支;其中链霉菌间的卤化酶序列相似性较高,而小单孢菌间的卤化酶序列差异较大.[结论]海洋来源的放线菌,尤其是海洋链霉菌,可作为未来获得新卤化活性物质的一类重要微生物资源.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高鹏	中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室	102	956	15.0	27.0
2	阮继生	中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室	11	141	7.0	11.0
3	黄英	中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室	55	854	18.0	26.0
4	郗丽君	中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室	1	19	1.0	1.0
5	朴玉华	中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室	1	19	1.0	1.0