龙须菜5.8S rRNA和ITS区的克隆与系统学分析

• 作者: 张学成 易恒 朱明 李敏 阎炳伦 隋正红
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 龙须菜 江蓠科 5.8S rRNA-ITS 系统发育
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 77-83
• 页数: 7页
• 分类号: Q75
• 字数: 4930字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5174.2009.01.009

摘要

研究青岛产龙须菜居群内的遗传多样性和系统学分类,通过对龙须菜居群内不同个体的5.8S rRNA-ITS区(包括ITS1-5.8S rRNA-ITS2)进行PCR扩增和序列分析,得到扩增DNA片段长度均为1 066 bp,包含完整的ITS1(250 bp)、5.8S(159 bp)和ITS2(657 bp);利用GenBank数据库对Cracilaria(江蓠属)和Gracilariopsis属共20个物种的rRNA-ITS相应序列进行了比较和系统进化分析.结果表明,龙须莱和江蓠科19个物种中rRNA的5.8S区的长度和序列非常保守,而ITS区的长度和序列则变异较大,20种江蓠科物种的遗传距离在0.013～0.596之间,龙须菜在5.8S rRNA-ITS区特性上相比江蓠属物种与Gracilariopsis属物种更为相似;采用UPGMA法构建了这20种江蓠科物种的系统发育树;分析结果表明青岛产龙须菜的居群内不存在遗传差异,且应属于Gracilariopsis属,并且在江蓠科中较早分化,而龙须菜处于Gracilariopsis属中比较古老的位置.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	隋正红	中国海洋大学海洋生命学院	46	403	10.0	18.0
2	李敏	中国海洋大学海洋生命学院	35	164	7.0	12.0
3	朱明	中国海洋大学海洋生命学院	7	254	7.0	7.0
4	易恒	中国海洋大学海洋生命学院	2	39	2.0	2.0
5	张学成	淮海工学院海洋学院	1	22	1.0	1.0
6	阎炳伦	淮海工学院海洋学院	1	22	1.0	1.0