泡桐丛枝植原体Sec分泌蛋白转运系统3个亚基基因的克隆及蛋白特性分析

• 作者: 吴云锋 吴宽 孙润红 岳红妮 张珏
• 来源期刊: 植物保护
• 学科: 农学
• 关键词: 泡桐丛枝植原体 Sec分泌蛋白转运系统 SecA,SecY和SecE亚基 生物信息学
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 25-31
• 页数: 7页
• 分类号: S763.14
• 字数: 4207字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0529-1542.2009.02.006

摘要

采用PCR方法扩增Sec分泌蛋白转运系统3个亚基基因,并进行了生物信息学分析.通过SWISS-MODEL同源建模与3D-PSSM折叠子识别法构建蛋白质的三维结构,并通过PROCHECK程序验证构建的三维结构的可靠性.首次从泡桐丛枝(PaWB)植原体基因组中分离出Sec分泌蛋白转运系统3个亚基基因,各基因全长依次为2508、1 242 bp和411 bp,分别编码835、204个及136个氨基酸的蛋白.SecA、SecY和SecE均为脂溶性稳定蛋白,SecA无明显跨膜区,SecY和SecE分别含有10个和3个明显的疏水跨膜区.二级结构主要为螺旋,其次为折叠和无规则卷曲,没有转角.构建的三维结构符合立体化学原则.泡桐丛枝(PaWB)植原体中存在的Sec分泌蛋白转运系统作为最主要的运输途径,可能直接转运菌体蛋白如毒素等直接到寄主细胞质中或介体昆虫细胞中,引起寄主病症.研究植原体的Sec蛋白转运系统对于了解植原体的致病机理及预防这类病害的发生提供了理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴云锋	西北农林科技大学生命科学学院	68	666	14.0	22.0
2	张珏	西北农林科技大学生命科学学院	4	46	3.0	4.0
3	岳红妮	西北农林科技大学生命科学学院	2	14	2.0	2.0
4	吴宽	西北大学信息科学与技术学院	4	16	3.0	4.0
5	孙润红	西北农林科技大学生命科学学院	1	8	1.0	1.0