水稻基因组MSAP指纹图谱构建及DNA甲基化修饰位点分离与鉴定

• 作者: 任正隆 周建平 张勇 张韬 彭金华 杨足君 邓科君
• 来源期刊: 高技术通讯
• 学科: 工学
• 关键词: 水稻 表观遗传 DNA甲基化 甲基化敏感扩增多态性(MSAP) CpG岛
• 年，卷（期）: 2009,（9）
• 所属期刊栏目: 遥感与生物技术
• 页码范围: 983-990
• 页数: 8页
• 分类号: TN94
• 字数: 4616字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3772/j.issn.1002-0470.2009.09.018

摘要

采用EcoR I和Hpa II/Msp I双酶切建立了适合于水稻基因组的甲基化敏感扩增多态性(MSAP)分析体系,在全基因组水平检测了水稻DNA甲基化修饰位点.以12对MSAP引物进行选择性扩增,共检测到甲基化修饰位点120个,"CCGG/GGCC"位点甲基化修饰比例为20.17%.对部分水稻基因组甲基化修饰位点进行回收,最终分离了55条存在甲基化位点变异的DNA序列,通过BLAST比对分析将其联配到水稻基因组序列上.分析表明,这些甲基化修饰位点主要集中于基因启动子区(47%)和第一外显子区(22%),在其侧翼序列中存在类似"CpG island" 典型序列特征的"CpG"二核苷酸成簇富集区.在此基础上,对应用MSAP技术分离水稻基因组DNA甲基化修饰位点的有效性以及水稻基因组序列中"CpG island"类似序列分布特征和生物意义进行了讨论.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨足君	电子科技大学生命科学与技术学院	55	636	15.0	22.0
2	周建平	电子科技大学生命科学与技术学院	27	319	12.0	17.0
3	任正隆	电子科技大学生命科学与技术学院	61	742	15.0	23.0
4	张勇	电子科技大学生命科学与技术学院	77	642	14.0	19.0
8	邓科君	电子科技大学生命科学与技术学院	23	255	8.0	15.0
9	张韬	电子科技大学生命科学与技术学院	5	43	3.0	5.0
10	彭金华	电子科技大学生命科学与技术学院	4	84	4.0	4.0