双胚苗水稻来源的单倍体、二倍体及其杂交F1的DNA甲基化位点分析

• 作者: 吴先军 吴绍华 张红宇 徐培洲 薛晶晶
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 双胚苗水稻 单倍体 DNA甲基化 MSAP miRNA
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 页码范围: 50-59
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2013.00050

摘要

全基因组倍增或多倍化,伴随着基因丢失和二倍化进程,被认为是植物进化的重要推动力量.DNA 甲基化与miRNA的表观遗传调控机制在植物生长发育及进化过程中起着重要的作用.本文采用MSAP (甲基化敏感扩增多态性)技术分析同一双胚苗水稻来源的单倍体、二倍体及其杂交F1的基因组DNA 5'-CCGG位点胞嘧啶的甲基化及遗传特点.对部分甲基化位点进行切胶、回收、测序及功能注释,并结合miRNA靶基因预测探讨特定甲基化位点的遗传特点及其与 miRNA 的相关性.16对选择性扩增引物在双亲及杂交 F1中共检测了462个 DNA 甲基化位点,杂交F1甲基化水平平均为43.20%,与双亲相近(单倍体为46.75%,二倍体为41.99%).TargetFinder软件分析发现其中的7个甲基化位点基因序列上存在1~4个 miRNA的结合位点,这些基因的功能注释包括逆转录转座子蛋白、ras相关蛋白、H2A/H2B/H3/H4核心组蛋白等.同时,探讨了逆转录转座子在植物进化中的作用.研究结果为进一步阐明水稻基因组倍增过程中DNA甲基化与miRNA的关系提供了参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴先军	四川农业大学水稻研究所/西南作物基因资源与遗传改良教育部重点实验室	16	94	7.0	9.0