叶绿体5S rDNA ITS和matK基因序列应用于刚竹属植物系统分类的可行性分析

• 作者: 何聪芬 刘蕾 李潞滨 缪崑 胡陶 董银卯 袁金玲
• 来源期刊: 分子植物育种
• 学科: 生物学
• 关键词: 竹亚科 刚竹属 5S rDNA ITS基因 mark基因
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 89-94
• 页数: 6页
• 分类号: Q94
• 字数: 4107字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-416X.2009.01.016

摘要

本文应用CTAB法从37种竹类植物中提取基因组DNA,根据在GenBank中发表的5S rDNAITS和matK基因设计引物,通过PCR进行扩增.结果表明:37种竹子5S rDNA ITS序列PCR产物大小约为450 bp,在刚竹属内部无长度上的差异,但是舒竹(Phyllostachys shuchengensis)与其他刚竹属植物相比,有一个位点的差异(由A变为C).因此,5S rDNA ITS在属下水平上无法提供较大的信息量,变异性较低,不适于刚竹属属下水平的系统分类研究.同样,选取37种竹子中3个竹种的,matK基因的PCR扩增产物直接进行测序,结果显示marK基因在竹亚科的属间长度上无差异,产物的长度约为1 500 bp,将测序结果进行同源性比对,在变异位点附近寻找多态性酶切位点,碱基序列上有一个位点的差异(BstN Ⅰ).PCR-RFLP结果显示,共有3种竹子在此位点发生变异分别为:浙江淡竹(Phyllostachys meyeri)、安吉金竹(Phyllostachysparvifolia)和黄古竹(Phyllostachys angusta).刚竹属植物的mark基因序列相当保守,片段中刚竹属间的绝对核苷酸差异不到1个,所提供的信息量不够充分.因此,叶绿体5S rDNA ITS和marK基因序列不适用于刚竹属植物系统分类研究,但其可能适合在属或属以上分类等级竹类植物的系统分类中应用.