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摘要:
目的 建立一套以TaqMan探针实时荧光PCR技术为基础的单核苷酸多态性(SNP)检测平台,并用于AKAP10基因2073A/G SNP的检测. 方法 设计一对TaqMan探针加入到PCR反应系统中,并设立阴阳对照,对AKAP10基因2073A/G SNP进行分型.同时验证部分样本PCR产物的直接测序结果 . 结果 运用TaqMan探针实时荧光PCR技术对AKAP10基因2073A/G SNP检测结果 准确,与PCR产物的直接测序结果 完全一致.AKAP10基因2073A/G多态性分布与性别年龄无关(P>0.05).非条件logistic回归分析提示,AKAP10基因2073A/G突变型(AG+GG)与野生型AA相比增加结直肠癌的发生风险(OR=1.52, 95% CI:1.07~2.15, P=0.019). 结论 通过合理设计TaqMan探针,设立阴阳性对照,应用TaqMan探针实时荧光PCR技术成功建立起一套SNP检测平台.AKAP10基因2073A/G多态性与结直肠癌发病存在显著相关性.
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文献信息
篇名 运用TaqMan探针实时荧光PCR技术检测AKAP10基因2073A/G单核苷酸多态性
来源期刊 四川大学学报(医学版) 学科 生物学
关键词 TaqMan探针 实时荧光PCR 单核苷酸多态性
年,卷(期) 2009,(2) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 275-278
页数 4页 分类号 Q34
字数 3294字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1672-173X.2009.02.021
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 周总光 四川大学华西医院消化外科研究室 189 1320 18.0 26.0
2 张鹏 四川大学华西医院消化外科研究室 85 397 11.0 16.0
3 王玲 四川大学华西医院消化外科研究室 111 310 10.0 12.0
4 张益 四川大学华西医院消化外科研究室 3 33 3.0 3.0
5 李园 四川大学华西医院消化外科研究室 40 166 7.0 11.0
6 王默进 四川大学华西医院消化外科研究室 14 82 4.0 9.0
7 崔长富 四川大学华西医院消化外科研究室 1 16 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
TaqMan探针
实时荧光PCR
单核苷酸多态性
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
四川大学学报(医学版)
双月刊
1672-173X
51-1644/R
大16开
成都市人民南路三段17号
62-72
1959
chi
出版文献量(篇)
5493
总下载数(次)
8
总被引数(次)
35558
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导