金属核酸酶及寡聚酰胺与双链DNA分子对接模式的理论研究

• 作者: 朱艳艳 漆遥 王艳 苏延伟 谭宏伟 陈光巨
• 来源期刊: 高等学校化学学报
• 学科: 化学
• 关键词: 金属核酸酶 分子对接 寡聚酰胺 AutoDock程序
• 年，卷（期）: 2009,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 781-785
• 页数: 5页
• 分类号: O641
• 字数: 3450字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0251-0790.2009.04.029

摘要

采用分子对接软件AutoDock分别研究了金属核酸酶、寡聚酰胺与DNA对接模式. 研究结果表明, 金属核酸酶、寡聚酰胺与DNA对接结果与实验数据吻合得较好. 在金属核酸酶与DNA的对接中, 最优构型都是金属核酸酶对接在DNA的小沟内. 随着中心金属上电荷的增加, 最大对接能呈现上升趋势. 尤其是配体体积较小的金属核酸酶, 最佳对接位点受中心金属上电荷影响较大, 即随着中心金属上电荷的从少到多, 最佳对接位点呈现多样化的趋势. 在柔性分子寡聚酰胺与双链DNA分子的对接中, 分子随DNA小沟的柔性变形是对接结合的关键. 其最佳的结合物位点也都是在DNA的小沟内, 其对接结果与晶体结构一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱艳艳	北京师范大学化学学院	2	7	2.0	2.0
2	苏延伟	北京师范大学化学学院	1	2	1.0	1.0
3	漆遥	北京师范大学化学学院	1	2	1.0	1.0
4	谭宏伟	北京师范大学化学学院	14	45	4.0	6.0
5	王艳	北京师范大学化学学院	21	436	8.0	20.0
6	陈光巨	北京师范大学化学学院	36	89	6.0	8.0