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猪脂联素基因启动子克隆及多态性研究
猪脂联素基因启动子克隆及多态性研究
作者:
凌飞
李仕新
杜红丽
汪亮亮
陈瑶生
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
猪BAC文库
脂联素基因
启动子
SNP
摘要:
[目的]为脂联素基因作为脂肪沉积候选基因的研究提供依据.[方法]通过猪BAC文库筛选及引物步移法(primer-walking)的测序方法获得脂联素基因的启动子序列,具体步骤:通过已经发表的部分猪脂联素基因cDNA序列设计特异引物用于BAC克隆的筛选.以超级池DNA为模板进行第1次PCR反应,筛出含阳性克隆的超级池;以挑出的阳性超级池的3维池DNA为模板进行第2次PCR反应,根据阳性板池、列池、行池序号得到町能的阳性克隆号;依照阳性克隆号从工作文库中取出相应的BAC克隆,平板划线37℃倒置培养20 h.待菌落长好后,做菌体PCR鉴定,以确认克隆的正确性.将获得的BAC阳性克隆平板划线,37℃摇菌过夜培养,进行BAC的提取、纯化与酶切回收.先以M13引物向BAC两端测序,再以发表的cDNA序列外显子1设计测序引物采用primer-walking的方法,获得连续的DNA序列.采用PCR-RFLP技术对蓝塘猪、大花白猪、大白猪、长白猪和杜洛克猪5个品种共290头猪的脂联素基因启动子区的多态性进行分析.[结果]脂联素基因的5'侧翼区-1 010 bp(G/A)的SNP位点,本地猪种中GG基因型频率明显高于外来猪种;-394 bp(T/C)的SNP位点,本地猪种基因型分布较为丰富,而在外来猪种中却没有检测到CC基因型,且外来猪中T等位基因频率较高.[结论]脂联素基因上游-1 010 bp(G/A)的SNP位点突变可能会引起该基因转录水平的改变,而-394 bp(T/C)的SNP位点与基因转录水平及与脂肪沉积可能无关.
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文献信息
篇名
猪脂联素基因启动子克隆及多态性研究
来源期刊
农业科学与技术(英文版)
学科
农学
关键词
猪BAC文库
脂联素基因
启动子
SNP
年,卷(期)
2009,(6)
所属期刊栏目
农业生物技术
研究方向
页码范围
53-56
页数
4页
分类号
S8
字数
735字
语种
英文
DOI
10.3969/j.issn.1009-4229-B.2009.06.018
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李仕新
华南农业大学动物科学学院
5
26
3.0
5.0
2
陈瑶生
中山大学生命科学学院
53
239
10.0
13.0
3
凌飞
华南理工大学生物与工程学院
15
119
6.0
10.0
5
杜红丽
华南理工大学生物与工程学院
34
132
6.0
10.0
8
汪亮亮
华南农业大学动物科学学院
3
19
2.0
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参考文献(1)
二级参考文献(0)
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参考文献(1)
二级参考文献(0)
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参考文献(1)
二级参考文献(0)
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参考文献(1)
二级参考文献(0)
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参考文献(1)
二级参考文献(0)
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参考文献(1)
二级参考文献(0)
2009(1)
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二级参考文献(0)
2009(1)
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二级参考文献(0)
引证文献(0)
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二级引证文献(0)
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引证文献(0)
二级引证文献(2)
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引证文献(0)
二级引证文献(2)
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脂联素基因
启动子
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研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
农业科学与技术(英文版)
主办单位:
湖南省农业科学院
出版周期:
双月刊
ISSN:
1009-4229
CN:
43-1422/S
开本:
16开
出版地:
长沙市芙蓉区湖南省农业信息与工程研究所
邮发代号:
42-209
创刊时间:
2000
语种:
eng
出版文献量(篇)
5310
总下载数(次)
12
总被引数(次)
15849
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