果蔗Hsp90基因的电子克隆及序列分析

• 作者: 周以飞 张燕云 张绪璋 林生 潘大仁 陈观水
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 果蔗 HSP90基因 电子克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2009,（12）
• 所属期刊栏目: 生物技术应用、组织培养及植物细胞学
• 页码范围: 1824-1830
• 页数: 7页
• 分类号: Q781
• 字数: 4383字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2009.12.021

摘要

以克隆到的果蔗HSP90基因片段作为探针,利用电子克隆和序列拼接方法获得一个全长为2 097 bp的cDNA序列.通过ORF软件分析.预测得到的蛋白质具有698个氨基酸.应用生物信息学对果蔗HSP90蛋白的理化性质、二级结构、疏水性,亲水性、信号肽、功能结构域分析及其蛋白功能、高级结构和同源性进行了预测分析.结果表明,该蛋白的相对分子量为80.2 ku,在N端有一个ATP结合位点,具有内源ATPase活性.序列分析表明,该蛋白可能具有信号转导、转录调控、胁迫应答、生长因子等功能.利用梢腐病病原Gibberella fujikuroi接种果蔗福安叶片,检测到HSP90基因的转录水平逐渐提高.