江西部分地区猪粪便戊型肝炎病毒核酸检测及序列分析

• 作者: 何后军 潘金发 谢宝东
• 来源期刊: 中国兽医杂志
• 关键词: 戊型肝炎病毒 RT-nPCR 基因型
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 调查研究
• 页码范围: 12-14
• 页数: 3页
• 分类号: S851.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0529-6005.2009.01.004

摘要

采集江西省A猪场2～3月龄猪粪便40份,B猪场2～3月龄猪粪便40份,利用反转录套式聚合酶链方法(RT-nPCR),检测戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)RNA,结果表明,A猪场7份样品为阳性,阳性率17.5%.B猪场10份样品为阳性,阳性率25.0%.总阳性率21.3%.对4份PCR扩增阳性产物进行纯化并测序,利用生物学软件进行序列分析和进化树绘制,4个分离株ORF2 348 bp同源性为92.1%～97.5%,为同一基因型,与HEV1、HEV2、HEV3同源性分别为70.7%～77.4%、72.5%~75.7%和71.6%～76.8%,与HEV4型的同源性79.2%～83.9%.4个分离株与HEV4型的代表株T1在同一分支上,属基因4型.与中国大陆6株猪源HEV比较,同源性为79.0%～87.3%,提示中国大陆猪源HEV的基因型比较一致,同属HEV 4型.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何后军	江西农业大学动物科技学院	88	530	14.0	18.0
2	谢宝东	江西农业大学动物科技学院	5	36	4.0	5.0
6	潘金发	江西农业大学动物科技学院	6	39	3.0	6.0