丁酸钠诱导K562细胞红系分化基因表达谱分析

• 作者: 付素珍 杨敏 赵丹华 钱新华
• 来源期刊: 实用儿科临床杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 丁酸钠 表达谱基因芯片 K562细胞 红系分化
• 年，卷（期）: 2009,（3）
• 所属期刊栏目: 血液/肿瘤疾病
• 页码范围: 174-177
• 页数: 4页
• 分类号: R725.5
• 字数: 4291字
• 语种: 中文

摘要

目的 分析丁酸钠(NaB)诱导K562细胞后的差异表达基因,筛选出与红系分化相关基因,探索NaB的作用机制.方法 应用Affymetrix公司的人类全基因组HG-U133 Plus 2芯片,检测0.5 mmol/L NaB诱导K562细胞48 h的珠蛋白基因变化及差异表达基因,筛选出与红系分化相关基因.应用反转录(RT)-PCR检测ε、γ、β、δ4个珠蛋白基因及2个红系分化相关基因KLF1及KLF3的表达,验证基因芯片结果 .结果 表达谱基因芯片结果分析显示:总探针组54 675个芯片中,阳性表达数23 175(42.4%),阴性表达数30693(56.1%).信号比对数值(SLR)结果显示,表达上调(SLR>1)433个,包含340个不同的基因;表达下调(SLR<-1)171个,包含144个不同的基因.生物学功能分类发现所涉及的基因主要包括参与细胞及大分子代谢、细胞信号、生物学调节、细胞发育及细胞增殖等.7个珠蛋白中ε、Aγ、Gγ、β、δ珠蛋白基因表达均上调,而α及ζ珠蛋白基因无明显改变;表达上调或下调且与红系分化相关的有ALAS2、EGR1、LMO2、RUNX1、KIT、GYPA、GATA-2、KLF1及KLF3等29个基因.RT-PCR验证基因芯片结果 可靠.结论 NaB诱导K562细胞向红系分化;NaB可能通过调节ALAS2、EGR1、LMO2、RUNX1、KIT、GYPA、GATA-2、KLF1及KLF3等与红系分化相关的基因调控γ珠蛋白合成.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钱新华	南方医科大学附属南方医院新生儿科	46	384	12.0	16.0
2	赵丹华	南方医科大学附属南方医院新生儿科	8	50	4.0	7.0
3	杨敏	广州市儿童医院消化科	1	1	1.0	1.0
4	付素珍	南方医科大学附属南方医院新生儿科	1	1	1.0	1.0