紫花苜蓿蛋白质二硫键异构酶mPDI的生物信息学分析与同源建模

• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 紫花苜蓿 蛋白质二硫键异构酶 同源建模
• 年，卷（期）: 2009,（33）
• 所属期刊栏目: 农业生物技术
• 页码范围: 16263-16267,16288
• 页数: 6页
• 分类号: S188
• 字数: 5512字
• 语种: 中文

摘要

紫花苜蓿蛋白质二硫键异构酶的基因已经被克隆测序.利用其mRNA及氨基酸序列,应用生物信息学软件预测了该蛋白质的理化性质、亲/疏水性、信号肽、二级结构、卷曲螺旋结构、跨膜区域、糖基化位点、活性位点、亚细胞定位、功能结构域及高级结构.结果表明,该蛋白质是一个整体疏水性蛋白,细胞定位为粗面内质网,含有512个氨基酸,理论等电点为4.98,信号肽位于1～24号氨基酸;二级结构中α-螺旋占26.37%(135AA),无规则卷曲占53.32%(273AA),延伸链占20.31%(104AA);包含3个卷曲螺旋结构,3个糖基化位点,2个硫氧还蛋白结构域,2个硫氧还蛋白活性位点.Ramachandram结构检测表明此模型的三维结构符合立体化学能量规则.