基于PCR-DGGE技术的红树林区微生物群落结构

• 作者: 刘慧杰 杨彩云 林光辉 田蕴 郑天凌
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: PCR-DGGE 红树林 微生物群落结构 细菌多样性
• 年，卷（期）: 2010,（7）
• 页码范围: 923-930
• 分类号: Q938.1
• 语种: 中文

摘要

[目的]为了解红树林沉积物中细菌的群落结构特征.[方法]应用PCR-DGGE技术对福建浮宫红树林的16个采样站位样品细菌的群落结构进行了研究.根据DGGE指纹图谱,对它们的遗传多样性进行了分析.[结果]各站位样品细菌多样性指数(H)、丰度(S)和均匀度(EH)均有所不同,这些差异与它们所处站位的不同有关,红树林区细菌多样性高于非红树林区细菌多样性.对不同站位细菌群落相似性分析,它们的相似性系数也存在一定的规律,同一断面的细菌群落结构相近性较高.对DGGE的优势条带序列分析,同源性最高的微生物分别属于变形菌门(Proteobacteria)、酸菌门(Acidobacteria)和绿菌门(Chlorobi),它们均为未培养微生物,分别来自于河口海岸沉积物.[结论]应用PCR-DGGE技术更能客观地反映红树林沉积物中真实的细菌群落结构信息.另外,研究也表明红树林区微生物多样性丰富,在红树林区研究开发未知微生物资源具有巨大的潜力.