松材线虫伴生细菌多样性的宏基因组分析

• 作者: 张祺玲 杨家荣 田雪亮 茆振川 谢丙炎 陈国华
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 松材线虫 伴生细菌 16S rRNA基因文库 454测序 宏基因组
• 年，卷（期）: 2010,（7）
• 页码范围: 909-916
• 分类号: Q938
• 语种: 中文

摘要

[目的]松材线虫是松材线虫病的病原,且与其伴生细菌之间存在互作关系,它们构成一个微生态系统.本研究旨在揭示松材线虫-伴生细菌群落细菌多样性.[方法]采用16S rRNA基因文库和454测序对伴生细菌群落的宏基因组进行初步分析.[结果]依据97%序列相似性划分OTU(Operational Taxonomic Unit),构建的16S rRNA文库包含25个OTU,分别属于Alphaproteobacteria、Betaproteobacteria、Gammaproteobacteria和Bacteroidetes,其中优势菌群为Gammaproteobacteria,特别是Stenotrophomonas maltophilia为优势细菌.在伴生细菌优势种群上,454测序结果与16S rRNA基因文库结果基本一致.[结论]松材线虫的伴生细菌多样性较高,这些细菌可能对松材线虫具有一定的生态意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢丙炎	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	175	3639	30.0	51.0
2	田雪亮	西北农林科技大学植物保护学院	77	521	13.0	17.0
5	杨家荣	西北农林科技大学植物保护学院	42	466	15.0	19.0
6	茆振川	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	40	564	12.0	22.0
7	陈国华	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	50	267	10.0	12.0
14	张祺玲	湖南农业大学生物安全科技学院	6	139	5.0	6.0