扩展莫尼茨绦虫基因芯片的制作及分析

• 作者: 张慧 李娜 王新华 薄新文 赵文娟
• 来源期刊: 寄生虫与医学昆虫学报
• 学科: 医学
• 关键词: 扩展莫尼茨绦虫 基因芯片 cDNA
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 所属期刊栏目: 著述
• 页码范围: 6-9
• 页数: 4页
• 分类号: R5
• 字数: 3256字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-0507.2010.01.002

摘要

通过EST计划获得1 080个基因片段,制备了扩展莫尼茨绦虫cDNA芯片.该芯片一个域有52行、78列,密度为863点/cm2,其中包含1 080个靶基因、9个阳性对照、16个阴性对照、8个空白对照,每个基因做3个重复.用扩展莫尼茨绦虫的成节与头颈节总RNA与芯片进行杂交,获得了成节与头颈节基因表达谱,芯片结果分析差异系数为0.1807,共找到91个在扩展莫尼茨绦虫成节高表达基因,幼节高表达基因81个,其他的基因表达差异不大.通过同源性比对分析,成节高表达基因主要有钙调节蛋白、外致密纤维精子尾、富含半胱氨酸蛋白前体和卵黄蛋白原等;头颈节高表达基因主要有果糖-二磷酸盐醛缩酶、皮层细胞蛋白和胶原等.该芯片可以进一步应用于扩展莫尼茨绦虫基因组等方面的研究,对基因表达差异进行高通量检测.