生物信息学对扩展莫尼茨绦虫cDNA文库Cavβ基因分析与B细胞抗原表位预测

• 作者: 康立超 王新华 王正荣 薄新文 赵文娟
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 扩展莫尼茨绦虫 Cavβ 二级结构 B细胞抗原表位 功能预测
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 页码范围: 735-742
• 分类号: S188|S852.73
• 字数: 4376字
• 语种: 中文
• DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2012.04.021

摘要

[目的]分离和鉴定扩展莫尼茨绦虫(Moniezia expansa)电压门控钙通道β亚基(cavB)基因,预测蛋白二级结构和B细胞抗原表位,从而探讨Cavβ在寄生虫病治疗中所起的作用.[方法]构建扩展莫尼茨绦虫成虫cDNA文库,随机挑取重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行引物步移法测序,获取全长cDNA序列；采用生物信息学方法对其对应的蛋白进行二级结构和B细胞抗原表位的预测.[结果]获得扩展莫尼茨绦虫Cavβ基因,全长946 bp,编码180个氨基酸,理论分子质量为19.788 8 kD,等电点为5.06,属于Ca_channel_B超家族.二级结构以无规则卷曲为主,结构预测存在4个可能的B细胞抗原表位.[结论]研究对于扩展莫尼茨绦虫Cavβ基因的获得和B细胞抗原表位的预测,为该基因功能的试验性鉴定工作奠定了基础.