一种基于线性流形的基因表达数据的聚类方法

• 作者: 倪青山 强波 王广云 王正志 黎刚果
• 来源期刊: 国防科技大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 基因表达数据 线性流形 子空间聚类 线流形
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 页码范围: 150-156
• 分类号: Q-332
• 字数: 6408字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-2486.2010.04.028

摘要

由于基因表达数据的稀疏性和噪声性,传统聚类算法对其聚类时不能取得好的效果.针对这一问题,一种新的线性流形方法被提出,它的基本思想是搜索数据集中的线流形聚类,再将其中某些线流形聚类融合构造高维流形聚类.该算法将切向距离和法向距离作为线性流形的距离度量,运用空间近邻信息,采用聚类基因的平均表达水平作为转移向量,提高了聚类的准确度.实验结果表明,该算法的聚类准确性优于其它聚类算法,并且对带有噪声的数据可以保持较高的聚类准确度;在对Hela基因表达数据聚类时,算法得到了具有显著生物学意义的聚类.这些都说明提出的算法对基因表达数据聚类的适用性和有效性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王正志	国防科技大学机电工程与自动化学院	85	629	13.0	20.0
2	倪青山	国防科技大学机电工程与自动化学院	22	72	5.0	7.0
3	王广云	国防科技大学机电工程与自动化学院	11	31	4.0	5.0
4	强波	国防科技大学机电工程与自动化学院	11	19	2.0	4.0
5	黎刚果	国防科技大学机电工程与自动化学院	3	10	2.0	3.0